Три гипотезы навскидку:
1) лярвированная (скрытая) депрессия
2) какие-то тропические паразиты (совсем не обязательно при этом в кишечнике, - м.б. печень, мышцы и т.д.)
3) онкопатология, - например, при раке желудка м.б. "синдром малых признаков": ничего конкретного, там недомогание, сям недомогание. Но и не только желудка.
Онкологу-то скорее всего уже показывался, прицельно бы к паразитологу и к психиатру (депрессия - его епархия).
Ну, это я навскидку, - если серьёзно заняться дифференциальной диагностикой, наверняка ещё направлений для обследования можно накидать.
Ошибок наделал...ну, простите.
Кроме вышеперечисленного, такую скрытую симптоматику имеет борреллиоз, и его трудно диагностировать (и, кстати, часто сначала лечат от депрессии).