Да. Многие знакомые так делали, я даже учился какое-то время в вечерней школе. Никаких проблем, никто при поступлении в ВУЗ не посмотрит на то в вечерней или дневной школе вы учились.
Просто большинство в вечерней школе пинают.. и не поступают после никуда. Ну и у людей, как обычно возникает миф о том что после вечерки никуда поступить не получится. Это просто миф.
Позвоните в ВУЗ, и спросите. Они вам ответят что нужен лишь ЕГЭ, после школы. И все. И можно поступать.