Можно ли в теории забросить царь-бомбу(58,6 мегатонн) с таймером вглубь Юпитера, чтобы получить воронку(тоннель) вглубь газового гиганта? Сколько бомб такого типа понадобится для этого?

Вы же сами сделали акцент на том, что Юпитер - газовый гигант.
Насколько я знаю, там нет твердой поверхности, твердое там только ядро.
А бомбить царь-бомбами ядро Юпитера (которые кстати не долетят до ядра, ввиду огромного давления), все равно что пытаться потушить солнце.