Можно ли работать педагогом, например, в школе, если закончить магистратуру в педагогическом, но бакалавриат был закончен в абсолютно другой области?

Да, можно.

Но может быть ряд нюансов, которые Вам обозначит администрация образовательной организации, в зависимости от их требований.

Бакалавриат в педагогическом ВУЗе предполагает освоение методик преподавания предмета/предметов, в магистратуре дается углублённая информация об этих методиках (сами методики не даются).  
Лично я ни одной положительной эмоции от магистратуры не получила и считаю её потерей времени и средств (и ничего нового я не узнала).  

Поэтому вполне вероятно, что Вас еще попросят пройти курсы профессиональной переподготовки, на которых и дают методику.

У меня дипломы бакалавриата и магистратуры учителя-логопеда (т.е. есть методики преподавания всех дисциплин начальной коррекционной школы) и когда я пришла в обычную общеобразовательную школу, условием приёма на работу были курсы профпереподготовки на учителя начальных классов. Моя одногруппница в магистратуре имела экономическое образование и опыт работы в банке, с дипломом магистратуры логопеда её без проблем взяли в обычный детский сад.