Здравствуйте!
Возникновение головной боли после физической нагрузки может быть связано с множеством причин: от сосудистых и неврологических до банального перенапряжения мышц шеи во время бега.
Лучше всего обратиться за консультацией к терапевту или врачу спортивной медицины и пройти назначенное обследование.