В текстовом редакторе Emacs gnu.org есть режим Org-mode orgmode.org Он предназначен для того, чтобы в простых текстовых файлах хранить любые заметки и списки задач, со структурой, поиском, организацией и много чем ещё.
Вот на этой странице перечислено, как люди организуют свою жизнь с помощью org-mode: orgmode.org
У этого режима есть отдельная горячка для сохранения кусков текста, веб-страниц и всего, что угодно, в файлы заметок, как Evernote Web Clipper, только локально.
Сам Emacs определённо кросплатформенный. Как минимум для андроида есть приложение Mobile Org, которое позволяет работать с файлами заметок org-mode на мобильнике без Emacs. Сами файлы заметок остаются простыми текстовыми файлами, и с org-mode вы просто получаете набор удобных горячих клавиш для упорядоченного их редактирования.
Блокнот! Такие же текстовые редакторы, практически, есть на всех платформах.
Ещё есть FocusWriter.
http://gottcode.org/focuswriter/
В качестве ежедневника можно использовать Sunbird от Mozilla.
Отличное приложение ColorNote для Android. Не жрет батарейку, в отличии от всяких EverNote и Any.DO. Можно закрепить в виде виджета.
Для ПК и Linux - Tomboy Notes. Там есть также отличная возможность прикрепить заметки на рабочий стол.
Evernote и Any.DO тоже не жрут батарейку, если выставить большой интервал синхронизации.