Да, ситуация не из приятных, но выход есть. Во первых, надеюсь у Вас есть справка по болезни, с ней идете в ваш деканат и обьъясняете ситуацию. Если ситуация очень запущенная, то просите дать Вам «академический отпуск». Для этого нужно будет написать заявление.