Внимание: описание работы грубое и неточное, за подробной информацией - в гугл.
Потому что мозг, через усилие пройдя рубеж, когда он требует сна, решает, что сон пока невозможен, и впрыскивает в кровь и нервную систему определенный набор плюшек, которые дают вам ещё несколько часов бодрствования. И если вы не можете уснуть в час-два ночи, значит, плюшки всё ещё в вас.
Раньше это было необходимостью, когда сонливость могла стоить жизни. Да и сейчас помогает, поэтому осталась со временем. Однако со сном так себе дружит, да.