Начнём с того, что Церковь никого не казнила, смертные приговоры всегда были прерогативой светской власти.
Про инквизицию я писал неоднократно и со ссылками на историков:
Про св. Жанну д'Арк, справедливо упомянутую в комментарии (хотя и сожжённую по приговору епископа исключительно по политическим причинам и ради карьеры), я писал здесь: thequestion.ru
Читайте вопрос, я не об этом спрашивал