Остановить фотон нельзя. Он всегда имеет скорость 300 000 км/сек. Но энергии у разных фотонов разные. Эту энергию может забрать другая частица, например, электрон, но уж никак не атом в целом. Если электрон полностью поглотил энергию фотона, то фотон перестает существовать.
Фотон может породить пару частица-античастица, и отдать этой паре свою энергию. Но аннигиляция это прямо противоположный процесс, в котором фотоны рождаются, а не погибают.