Такие заклинания, как Люмос, Нокс, Репаро(т.е. небольшие и не слишком значимые) не преследуются Министерством. Что ж о заклинании, которое проделал Добби, то во-первых, он это сделал на глазах у маглов, а во-вторых, заклинание левитирования слишком заметное и может выдать существование волшебников.
Потому что он был под одеялом! Да, конечно, в фильме/книгах об этом ничего не сказано, но другого объяснения не найти.
Можно еще считать это просто режиссерским косяком или не замечать, как делают большинство посмотревших фильм (и действительно, у меня, например, эта сцена не вызвала подозрений).