Потому, что унитаз имеет так называемый водяной замок. Для того, чтобы запахи из фановой трубы не шли в квартиру. В трубе то фановой, что отходит от унитаза в нормальном состоянии воды нет, то есть если бы она была открыта, был бы запах.
Как устроен водяной замок лучше увидеть: kn3.net
В замке может быть или определенная порция воды, или меньше, если она высыхает, когда никто долго не пользуется. Если воды вылить в унитаз больше, то больше из замка и вытеснится. Если меньше, то вытеснится меньше.