Как советское руководство должно было поступить с польскими военнопленными в 1940 году, предполагая, что их государственность навсегда утрачена?

Так как их государства больше нет, то и смысла в пленных тоже нет: они не могут стать предметом переговором или обмена. В таком случае, у государства есть несколько путей:

1. Отпустить их на их родину, находящуюся теперь в составе СССР.
2. Оставить в заключении, использовать как рабочую силу.
3. Ну... Вы знаете какой вариант выбрали в СССР