Сейчас это слово используется широко - в значении "нелюбовь к гомосексуалистам". Но введено оно в обиход в 1960-е гг. психологом Джорджем Вайнбергом именно в значении "страх перед гомосексуалистами". Вайнберг использовал его для описания безотчетного страха гетеросексуальных мужчин, что их могут почему-то посчитать гомосексуалистами. Это провоцирует их на "гипермужское", брутальное поведение, неразрывно связанное с унижением женщин и оскорблением гомосексуалистов, чтобы никто не дай бог не подумал, что они им симпатичны :) С тех пор термин используется очень широко, впитывает всё новые значения, - но сема (единица смысла) страха в нем остается неизменной. Например, она живет в стойком убеждении многих людей в том, что гомосексуалисты могут кого-то (ну подсознательно их самих, конечно), "переучить", "переубедить", "распропагандировать" и "заставить" самих стать гомосексуалистами. Отсюда и законы о запрете "гей-пропаганды" и прочие ограничительные меры - чтобы этих брутальных мужчинских мужчин геи не убедили стать геями :) Так что от семы страха не деться никуда - она в этой парадигме живет и здравствует.
Брезгливость - все же немного другое чувство. Это скорее страх замараться чем-то постыдным, в нем меньше агрессии и больше стыда. Поэтому чем брезгуют - о том обычно не говорят. Часто ли вы без всякого повода начинаете докучать окружающим рассказами, как неудачно вляпались в дерьмо? Или как вас вырвало на собственные штаны? Вряд ли. А вот о чужом гомосексуализме вы готовы неспровоцированно рассуждать ежедневно. Это похоже на ежедневные вопросы на TQ - "Как жить, если знаешь, что умрешь?". То есть по уровню агрессии и тревоги, у вас это тоже не брезгливость, а страх.
Термин самостоятельный, и греческий корень -фоб- необязательно отсылает в прямом смысле к страху и фобиям. Гомофобия не является фобией в клиническом смысле. Сравните с ксенофобией или гидрофобностью, которая вообще физическое свойство предметов.
Впервые термин «гомофобия» употребил американский психиатр Джордж Вайнберг в 1972 году.