Византия - слово (древне)греческое (Βυζάντιον). В отличие от Бостона.
В разные периоды и разных регионах греческий звучал по-разному в зависимости от диалекта. Из Константинополя (Византии) благодаря православию в русском языке оказалось некоторое количество слов, которые в латинском написании произносятся через звук "б". Были времена, когда правильно было писать и говорить "вифлиотека" (библиотека). 8)
Отличия также наблюдаются в звуке "ф" (th): Фёдор - Theodor, кафедра - cathedra; и некоторых других.