Во время дождя муравьи засыпают входы в муравейник, чтобы их не залило (они успевают это сделать, так как их довольно большое количество). Муравейник находится не только на поверхности земли, часть находится под землей. Кроме того, муравейник укрепляется. Муравьи разных видов строят гнезда по разному, есть даже кочующие. Поэтому муравейники обычно защищены от дождя.
Во время зимы муравьи в холодных регионах впадают в "спячку" закапываясь глубже и строя себе специальные камеры для зимовки либо просто менее активны, в теплых же зима игнорируется.