Если в настройках YouTube в оповещениях отключить всё, что под "комментарии и действия", на сайте прекратят эти уведомления появляться или на почту приходить?

Да, оповещения под колокольчиком пропадут. 

А на счет почты, всегда внизу письма есть кнопка отказаться от рассылки, отписаться. Если на нее нажать, то вам перестанут приходить любые оповещения о вашем Ютуб аккаунте.

Нет. Некоторые оповещения (уведомления) будут приходить, пока Вы не отмените их в "Настройках аккаунта" на YouTube, раздел "Оповещения". Не(!) только в подразделе "Комментарии и действия".