Пустят. Но если вы при этом посетили Нагорных Карабах, то о въезде в Азербайджан можете забыть. Так как правительство Азербайджана считает эти территории оккупированными Арменией, и посещение требует определенного разрешения.
Почти такая же история с Крымом. Только в этом случаем был законный референдум.