Правда ли, что в маршрутках застрахованы только сидячие пассажиры? Как осуществляются выплаты в случае аварии, если в маршрутке были и стоячие пассажиры тоже?

Если в маршрутке не предусмотрено конструкцией стоячих мест, то "нелегальные" стоячие пассажиры не застрахованы. Выход - не садиться в маршрутку, если в ней нет свободных мест.