В зависимости от задачи, такое делается достаточно легко. VPN-туннелирование, каскады прокси-серверов, зомби-сети и т.д. - все это легко поможет скрыть того, кто управляет атакой.
Точно также мы можем показать кому нужно (если точное знаем где расположен honeypot) фиктивный управляющий центр, о чем видимо и говорил Путин.
На вопрос "кто это делает" отвечать бессмысленно. Так поступают все заинтересованные специалисты определенного рода по информационной безопасности. Вне зависимости от страны проживания.
У меня в голове был более продвинутый ответ, но скорее всего это никому интересно.)
Э... как бы вам помягче то. Вы уверены что надо воспринимать слова Путина как технический комментарий? Ни Путин, ни его спичрайтеры не имеют никакого специального технического образования в области безопасности информационных систем, систем передачи данных и т.д. зато они имеют политический опыт, исходя из которого и делают заявления.