Шенгенская виза открыта из Москвы в Испанию, но впервые въехать в Испанию получится из США через Англию. Будут ли какие-то проблемы с Шенгеном?

Нет, не будет совсем. США, Англия, Испания - три совершенно разных визовых режима. Не важно, откуда ехать в Испанию, главное туда въехать первой из других шенгенских стран (ну или провести в Испании больше времени за один раз, чем в других шенгенских странах)