Если измену исключаем (хотя эта версия наиболее подходит), то это редкий случай передачи этого признака в рецессивной форме.
Но так как такого не описано в литературе, то это оооочень маловероятно.
Обычно белая кожа, светлые глаза являются рецессивными, что означает, если второй родитель будет чернокожим (с доминантным наследованием), то как минимум 50% детей будут чернокожими или мулатами, если родитель гетерозиготен.
Темная кожа - доминантный признак, который проявился бы и у родителя, имеющего такой ген. Если отцовство несомненно, то остается один вариант - случайная мутация.