на каких рынках? чем торговать то - валюта? деривативы? акции? В РФ или штаты? Под Линуксом я буду иметь ввиду Убунту. По основным пробегусь:
Quik можно запустить под Wine; вот человек рассказывает athunder.livejournal.com
если речь идет о МетаТрейдере, то вот ссылка как ставить ч/з Wine
у ThinkorSwim есть версия под Линукс
у NinjaTrader всё сложно, вот через CrossOver ставили 7ю версию; но реальнее через Parallels
у Volfix есть возможность работать под Линукс, нужно списаться с тех поддержкой для деталей
АТАС не будет работать под Линукс, только через Parallels