В школьных учебниках история 90-х точно была с конца 90-х гг. Когда курс современной истории появилось в вузах, сложно сказать точно, но, например, на истфаке МГУ вроде бы в начале 2000-х стал читаться соответствующий курс.
В разы сложнее сказать, с какой целью решили изучать историю современной России. Здесь я могу лишь предполагать. С одной стороны, это наша история и её следует знать. С другой, в школьных учебниках материал по 90-м зачастую сопровождался дискуссионными заданиями, следовательно, авторами предполагалось развитие критического подхода у школьников к современным событиям.