Как обьяснить тот факт,что чувствуя себя усталым,больным,я одновременно сильнее чувствую угрызения совести,а когда все в порядке их практически не бывает?

Я бы рассмотрел вариант, где причина - угрызения совести, а следствие - усталость, недомогание.

Ну вроде как в школе встречаются случаи, когда внушаемый ученик о-о-очень боится идти в школу и у него даже температура тела поднимается.

Одно из возможных объяснений в том, что в состоянии усталости у вас меньше энергии, меньше сил, соответственно ослабляются и защитные механизмы психики, поэтому угрызения вылезают на поверхность. Точно также в состоянии усталости даже какие-то пустяки, слова и т.п. могут вызывать раздражение.