В МГУ имени Ломоносова есть биологический факультет, на втором, зоолого-ботаническом, отделении которого, на кафедре антропологии готовят антропологов по отечественной традиции - физических. Посмотрите сайт MSU.RU
Учиться на физического антрополога можно на кафедре антропологии биофака МГУ, также есть аспирантура в Москве в ИЭА РАН и ИА РАН по этой специальности, в СПБ - МАЭ РАН (Кунсткамера).