Аминокислоты местной фауны (если она обнаружится) проблемы не составят, поскольку всегда можно привезти с собой растения с привычными нам аминокислотами и выращивать их на новом месте.
Состав окружающей среды (прежде всего атмосферы) может оказаться несколько большей проблемой, но в целом тоже разрешимой, поскольку всегда можно для начала оборудовать закрытые хабы и станции с собственной атмосферой и средой.
Гораздо более серьезная проблема для колонизации экзопланет - это тот факт, что ближайшая к нам звезда расположена в нескольких световых годах, а так же необходимость защиты колонистов от космических лучей и радиации как по дороге на эту планету, так и на самой планете (если у нее нет достаточно мощного магнитного поля).
Не факт, что человек сможет вписаться в тамошнюю экосистему, но нет причин, по которым человек не смог бы создать там филиал земной экосистемы - с соответствующими флорой и фауной.
Что касается состава атмосферы, то до некоторой степени он, конечно, поддаётся коррекции, но, в общем, сильно неподходящие планеты вряд ли станут объектами колонизации.