Критиков у Фрейда было множество, и каждый критиковал его по разным причинам. Юнг за то, что игнорировал социальные аспекты. Фромм - за игнорирование Маркса. Павлов - за игнорирование физиологии мозга. А бихевиористы вообще отрицали воздействие психических процессов на поведение.
Наиболее распостранённая претензия - невозможность проверки теории психоанализа эмпирическими методами. Из современных критиков можно упомянуть Дрю Уэстена.