На сколько я понимаю, страдают при курении в основном легкие. Остальные болезни в большенстве случаев надуманны. Посему смею предположить, что забитые легкие будут мешать Вам правильно дышать при выполнении упражнений, а правильное дыхание играет огромную роль. Так что да, курение навредит.