Включить в рабочем режиме хотя бы на полчаса. Подходит для большинства бытовых фильтров. Большие фильтровальные установки лучше включать по прилагаемой инструкции.

Проще всего - аэрацией воды. В накопительный бак подается воздух от компрессора, на дно ставятся аэраторы (по типу используемых в аквариумах). Ещё один вариант - аэрационная колонна.

Сделать анализ воды, при необходимости поставить аэрационную колонну (обезжелезиватель). Проверить содержание железа можно простым отстаиванием - наутро секдующего дня дожен появиться бурый осадок.

Если вкратце: механическая (фильтры, фильтрующие засыпки), биологическая (бактерии), химическая (реагенты, озон и пр.).

Тип очистки всегда подбирается в зависимости от конкретной задачи.