Маловероятно, что прога ошиблась, спасти диск тоже не получиться, если посыпался значит дохнет, в идеале заменить диск, или отпилить пространство на котором ошибки
С этим справятся сторонние деинсталяторы, например - Revo Uninstaler или Uninstal Tool удалят без проблем как из директории так и из реестра. Я обычно ими пользуюсь
Вариантов может быть несколько, перегрев устройства, постоянное обращение к hdd ( посмотрите насколько процентов загружен hdd), мало свободного пространства озу... в целом нужна диагностика